Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
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