Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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