Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rnf149Q3U2C5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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