Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shcbp1lQ3TTP0 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms