Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gtf3c3Q3TMP1 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gtf3c3Q3TMP1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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