Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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