Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms