Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms