Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 AC155293.1-201ENSMUST00000219793 1026 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms