Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms