Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Sh2d1a-207ENSMUST00000189753 1223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm42733-201ENSMUST00000201272 519 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms