Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cxcr5Q04683 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Cxcr5Q04683 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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Cxcr5Q04683 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms