Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl7Q03366 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms