Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms