Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms