Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms