Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptprn2P80560 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ptprn2P80560 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ptprn2P80560 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ptprn2P80560 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Ptprn2P80560 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptprn2P80560 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Ptprn2P80560 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms