Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SbdsP70122 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SbdsP70122 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SbdsP70122 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SbdsP70122 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SbdsP70122 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SbdsP70122 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SbdsP70122 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SbdsP70122 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SbdsP70122 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SbdsP70122 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms