Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms