Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms