Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Zbtb34-202ENSMUST00000113158 6602 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Adgrf4-201ENSMUST00000024711 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Zfp385b-201ENSMUST00000090766 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Apol7b-201ENSMUST00000089469 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Rbm19-201ENSMUST00000031590 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Ube2l3-202ENSMUST00000115699 2906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Ccdc148-201ENSMUST00000077687 3977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Phka2-201ENSMUST00000033652 4133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Hnrnpk-221ENSMUST00000177497 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Slc7a9-202ENSMUST00000118383 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sem1P60897 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sem1P60897 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Col19a1-201ENSMUST00000051344 3336 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sem1P60897 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sem1P60897 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms