Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NcanP55066 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NcanP55066 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NcanP55066 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NcanP55066 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NcanP55066 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NcanP55066 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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