Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Efnb1P52795 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms