Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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