Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TfamP40630 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TfamP40630 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TfamP40630 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TfamP40630 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TfamP40630 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TfamP40630 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TfamP40630 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TfamP40630 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TfamP40630 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TfamP40630 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TfamP40630 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TfamP40630 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TfamP40630 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TfamP40630 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TfamP40630 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TfamP40630 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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TfamP40630 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TfamP40630 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TfamP40630 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TfamP40630 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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