Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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