Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pabpc1P29341 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms