Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Hoxd10P28359 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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