Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms