Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ggta1P23336 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ggta1P23336 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms