Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms