Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SftpcP21841 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SftpcP21841 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SftpcP21841 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SftpcP21841 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SftpcP21841 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SftpcP21841 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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SftpcP21841 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SftpcP21841 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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SftpcP21841 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SftpcP21841 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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SftpcP21841 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SftpcP21841 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SftpcP21841 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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