Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms