Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TP20293 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TP20293 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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