Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifrd1P19182 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifrd1P19182 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms