Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lama1P19137 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lama1P19137 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lama1P19137 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lama1P19137 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Lama1P19137 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lama1P19137 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms