Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18524 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18524 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms