Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms