Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms