Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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RhoP15409 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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RhoP15409 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RhoP15409 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RhoP15409 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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