Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Atp6v1h-205ENSMUST00000192847 1662 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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