Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms