Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Foxd2O35392 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Foxd2O35392 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Foxd2O35392 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Foxd2O35392 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Foxd2O35392 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Foxd2O35392 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Foxd2O35392 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Foxd2O35392 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms