Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp12O08736 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms