Protein–RNA interactions for Protein: J3QMH4

Gm21866, Predicted gene, 21866, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21866J3QMH4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21866J3QMH4 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms