Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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