Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vmn1r34G3XA52 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vmn1r34G3XA52 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vmn1r34G3XA52 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Vmn1r34G3XA52 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Vmn1r34G3XA52 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Vmn1r34G3XA52 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Vmn1r34G3XA52 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Vmn1r34G3XA52 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Vmn1r34G3XA52 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Vmn1r34G3XA52 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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