Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms