Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6685D3YYP3 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms