Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmf1B9EKI3 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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